Точность РСН определяется в значительной степени особенностями и характеристиками систем, применяемых для управления их полетом. Системы управления РСН в процессе их развития претерпели значительные изменения. На первых образцах МБР, например, применялись системы, включавшие радиотехнические устройства. Ракеты в полете были связаны с Землей. Такие системы были явно неудобными для боевого применения ракет, и от них вскоре отказались.

К настоящему времени наиболее реальными для РСН являются три способа управления их полетом (и полетом боеголовок) и три соответствующих типа систем управления: инерциальная автономная СУ полетом ракеты на АУТ; управление полетом ракеты с использованием внешних источников информации; управление полетом отделившихся боеголовок с коррекцией их траектории по картам местности. На всех современных МБР применяется первый из перечисленных типов СУ. Он использовался и для ряда образцов БРПЛ.

В этом случае все устройства, обеспечивающие управление полетом ракеты, находятся на ее борту и не получают после старта никакой информации от внешних источников. Одним из вариантов автономных систем являлась система, действие которой основывалось на том, что по известным точкам старта ракеты и местоположения цели рассчитывалась потребная траектория ракеты (попадающая траектория), и система управления после пуска с возможно большей точностью обеспечивала Движение ракеты по этой траектории.

Для этого необходимо было обеспечить: движение центра масс ракеты по попадающей траектории; изменение угла наклона продольной оси ракеты к плоскости горизонта в месте старта по заданной программе с получением к концу АУТ требуемого угла бросания; отсутствие угла между, продольной осью и плоскостью стрельбы (угла рыскания) и угла поворота ракеты вокруг продольной оси (угла вращения или угла крена). Кроме того, для достижения заданной дальности требуется выключать Двигатель последней ступени в тот момент, когда скорость ракеты достигнет определенного значения.